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Time of sample collection is critical for the replicability of microbiome analyses

Investigadores: Celeste Allaband, Amulya Lingaraju, Stephany Flores Ramos, Tanya Kumar, Haniyeh Javaheri, Maria D. Tiu, Ana Carolina Dantas Machado, R. Alexander Richter, Emmanuel Elijah, Gabriel G. Haddad, Vanessa A. Leone, Pieter C. Dorrestein, Rob Knight, Amir Zarrinpar

Año publicación: 2024

Medio: Nature Metabolism

En este análisis retrospectivo de los estudios de secuenciación de amplicón 16S en ratones machos, se evidenció que el tiempo de recolección de la muestra afecta las conclusiones extraídas de los estudios del microbioma y su tamaño del efecto es mayor que el de una intervención experimental diaria o los cambios en la dieta. Los tiempos de recolección de muestras tan cortos como solo 4 horas de diferencia pueden llevar a conclusiones muy diferentes.