Los metabolitos del colesterol, en particular las formas oxidadas conocidas como oxiesteroles, desempeñan papeles cruciales en la modulación de los procesos inmunitarios y metabólicos en varios tejidos. Las concentraciones locales de colesterol y sus metabolitos influyen en las respuestas inmunitarias específicas de cada tejido al dar forma a la organización metabólica y espacial de las células inmunitarias en órganos de barrera como el intestino delgado y los pulmones. En este trabajo se explora la evidencia molecular y celular reciente que respalda la adaptación metabólica de las células inmunitarias innatas y adaptativas en el intestino delgado y el pulmón, impulsada por el colesterol y los metabolitos del colesterol. La investigación futura debería desentrañar los mecanismos moleculares detallados y las adaptaciones espaciotemporales que involucran a los metabolitos del colesterol en distintos tejidos mucosos en homeostasis o infección. Los autores postulan que las intervenciones farmacológicas dirigidas a la generación o detección de metabolitos del colesterol podrían aprovecharse para mejorar la protección inmunitaria a largo plazo en los tejidos mucosos o prevenir estados autoinflamatorios.